核算办法中会计科目的设置原则如下：
1.按科学、统一、规范的要求设置。第一，会计科目应确切反映会计核算的经济内容，是某一项经济业务的专业术语；第二，各地区、各部门相同的基金业务，应当采用相同的会计帐户核算和会计处理方法；第三，会计科目的规范是经济业务的处理和加强会计核算工作的前提。
2.既要与国家统一的会计政策相协调，又要体现社会保险基金的特点。社会保险基金会计科目，应符合核算的实际情况，确切反映基金的特点。同时也应符合《中华人民共和国会计法》的要求。
3.对会计科目使用说明尽量做到简炼，以保持会计的科学性和独立性。会计做为一门独立的学科，技术性较强，对会计科目的使用说明，尽量以简炼的会计语言加以陈述。
4.为了满足会计电算化的需要，对会计科目进行了统一编码，并在某些会计科目之间留有空号，以供根据需要增设会计科目时使用。
根据以上原则社会保险基金会计核算办法对会计科目分为资产类、负债类、基金类、收支类等四大类。
第一类：资产类会计科目。这类科目包括养老保险基金运行过程中形成的现金、银行存款、财政专户存款、债券投资、暂付款等项目。
第二类：负债类会计科目。这类科目是指养老、失业保险基金运行过程中形成的各种哲收款。主要包括暂收款科目。
第三类：基金类会计科目。这类科目是指企业职工养老、失业保险基金收支相抵后的余额，包括当期结余和前期结余。主要包括基本养老基金、失业保险基金、固定资产基金、生产自救周转金等科目。
第四类：收支类会计科目。收入是指养老、失业保险基金的各项收入；支出是指养老、失业保险基金的各项支出。
根据会计管理的需要，会计制度一般只规定一级科目或二级科目，明细科目通常由使用单位根据实际情况和自身核算的需要设置。对一级科目制度也规定，使用单位可以根据需要增加、减少或合并一级科目，但在编制会计报表时，应按会计核算办法的规定填列。
